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有些组织形式能够对业主及投资人提供一定程度的保护，如公司制企业的有限责任原则，就是对其个人财产的有效保护。选择组织形式时要权衡各种形式赋予业主的法律和经济责任，将责任控制在其愿意承担的范围内。私营独资企业的无限责任以及私营合伙企业的无限连带责任就给投资者的个人和家庭财产带来了风险。
不同的企业组织形式所适用的税收政策是摘于不同的，而且税收政策对企业的影响是长期的，也是非常重大的，因此，应比较不同组织形式的税率和征收方法。私营有限责任公司要双重征税，而私营独资企业和私营合伙企业，就可以避免双重征税的问题。
企业主要评估自己的管理能力，如果自己不擅长管理，就应该选择那些能够将多种人才纳入企业内部的组织形式。私营独资企业基本上全部依赖于业主的个人能力；私营合伙企业的合伙人就可以实现优势互补；而公司制企业中的经营权和所有权的分离，则可以让专业的管理来经营企业。
在不同的企业形式下，企业主对企业的控制能力是不一样的，有的权力高度集中而有的就相当分散。企业主要权衡他愿意放弃的控制力和想要获取的他人的帮助。在私营独资企业中，业主一人拥有经营决策权；私营合伙企业的每个合伙人都可以参与企业的管理；而在公司中，每个股东都有权力干预企业的经营。
不同企业形式在组建时的资本需求是不同的，业主应根据自己的资金情况选择。同时，不同形式的融资能力也不相同，在需要追加投资时的难易程度也是不相同的。私营独资企业的初创成本要求低，但未来的融资能力也差；公司制企业的初始投资大，但能募集到的资本也更多。
选择何种企业方式，和创业者要进入的行业有很大关系。私营独资企业比较适合于零星分散的小规模经营，在个体农业、建筑手工业、零售商业以及服务行业和自由职业中所占比例较大。一些行业的创业者必须要有合作精神，要建立起合作的团队，这就需要考虑私营合伙企业。比如创办律师楼、顾问公司、培训机构等等，如果没有合伙人，很难开展业务。而对资金、技术依赖性强的行业，也不适合单干。有限责任公司的行业范围更广，可以考虑贸易、电子、化工等行业。